2025 Workshop en Modelamiento de Sistemas Biológicos
Para esta tarea, escriba las ecuaciones químicas, encuentre las ecuaciones de nullclines (de ser posible; caso contrario, mencionar por qué no se pudieron encontrar), simule las trayectorias en el tiempo de uno de los siguientes modelos:
• Controlador brink: Replique la Figura 4 - Panel B y Panel C del siguiente artículo:entra aquí.
Controlador dual-rail: Replique la Figura 5 - Panel C del siguiente artículo: click aquí.
Controlador adaptativo: Usar el ejemplo visto en clase, donde se modeló un gen que inhibe su propia expresión, pero reemplazarlo por el sistema dual-feedback propuesto en la tarea D2_1.
Proponer al menos dos implementaciones biológica de los controladores vistos en la clase. Es decir, del controlador proporcional (P) o del controlador adaptativo basado en la red IFFL.
Proponga aplicaciones tecnológicas (e.g., en salud, ambiente, manufactura) donde puedan aplicarse este tipo de controladores biomoleculares.
Escribir la matriz de estequiometría, la matriz de probabilidades y realizar las simulaciones estocásticas correspondientes de una de las reacciones listadas en la tarea D3_1.