Redes neuronales biomoleculares

Simulaciones recomendadas

D4_1. Redes neuronales biomoleculares utilizando otras reacciones químicas

Para esta tarea, escriba las ecuaciones químicas, encuentre las ecuaciones de nullclines (de ser posible; caso contrario, mencionar por qué no se pudieron encontrar), simule las trayectorias en el tiempo de uno de los siguientes modelos:

• Degradación catalítica: Replique la Figura 3 del siguiente artículo: entra aquí.

Ciclo de fosforilación y desfosforilación: Replique la Figura 6 del siguiente artículo: click aquí.

Simulaciones opcionales

D4_2. Demostración de la función de activación

Demuestre que la expresión en estado estacionario del sustrato en la reacción de degradación catalítica se aproxima a una función de activación ReLU cuando el secuestramiento es muy alto (i.e., en el límite cuando $\gamma \to 0$, o equivalentemente, cuando $K \to 0$).

D4_3. Aplicaciones

Proponga aplicaciones tecnológicas (e.g., en salud, ambiente, manufactura) donde puedan aplicarse las redes neuronales biomoleculares. Nota: La aplicación no debe ser necesariamente una tarea de clasificación.